Curso de Posgrado “Modelado Molecular”

Curso modelado molecular

 

Mar del Plata, Buenos Aires, Argentina, septiembre 2018

Lugar: FCEyN, UNMDP

Comienzo: Jueves 13 de septiembre, 14hs (teoría, aula a confirmar)

Trabajos Pácticos de Laboratorio de Cómputos: Viernes de 14hs a 18hs

Carga horaria: 110 horas totales

DOCENTES:

Profesor: Dr. D. Mariano A. Vera.  dmavera@yahoo.com

Ayudante: Bioq. Priscila A. Lanza Castronuovo. priscilailin@hotmail.com

 

CONTENIDOS MÍNIMOS:

 

 

Tema 1: Modelado Molecular. Concepto de Superficie de Energía Potencial. Geometrías moleculares de mínima energía. Algoritmos de minimización. Aspectos esenciales del Análisis Normal. Espectroscopía IR/Raman Coordenadas de reacción.

Tema  2: Mecánica Molecular aplicada. Campos de fuerza: funciones potenciales y parametrización.Energía estérica y de tensión. Métodos MMx, AMBER, CHARM; campos empleados en sistemas biológicos; campos auxiliares y campos “universales”.

Tema 3: Estudios conformacionales, geométricos y de interacciones moleculares. Análisis multiconformacional. Métodos al azar. Algoritmos Genéticos. Introducción al Docking molecular. Validación de modelos. Flexibilidad. Docking masivo.

Tema 5: Introducción a los métodos de Química Cuántica (QC) y su aplicación. Concepto de Correlación electrónica y tipos de Métodos de QC. Conjuntos de bases. Métodos ab initio tradicionales. Introducción a la teoría del funcional de la Densidad (DFT). Consideraciones prácticas y computacionales. Impacto del cálculo en paralelo y de las GPUs en diferentes desarrollo de funcionales. Introducción al estudio de estados excitados y TD-DFT.

Tema 6: Introducción al análisis de la densidad electrónica. Dónde quedó la representación de Orbitales moleculares?. Orbitales Naturales de enlace. Laplaciano de la densidad electrónica. Funciones de localización electrónica. Revisitando el enlace químico (como cuando éramos jóvenes...).

Tema 7: Efecto de la solvatación sobre estructuras, propiedades y reactividad.Modelos continuos y discretos. Métodos híbridos Química Cuántica/Mecánica Molecular (QM/MM). Efecto del microentorno en sistemas moleculares. Superficies e interfases. Micelas. Bicapas lipídicas, Sistemas Macromoleculares huéspedes.

 

Pre inscripción: 
Asunto: "Curso"
a:  dmavera@yahoo.com

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