La misión del INBIOTEC es generar conocimientos básicos, desarrollos y transferencias tecnológicas, y la formación de RRHH, que atiendan a problemáticas vinculadas con el sector agropecuario, medioambiental y bioenergético, atravesadas por el estudio de la biodiversidad nativa, para la preservación y jerarquización de los recursos naturales de la región.