Química Computacional Aplicada al Estudio de la Resistencia a Múltiples Drogas (MDR). Antitumorales e inhibidores a partir de compuestos aislados de plantas de Argentina.

Docentes: Dr. Mariano Vera,  Bioq. Lanza Castronuovo

Plazas: 1

Carga horaria: 4 meses. 8 hs. semanales

Requisitos: 

• Fisicoquímica I (Licenciatura)
• Fisicoquímica (Bioquímica)
• Química Orgánica I (Bioquímica)

Tareas a realizar: Se llevarán a cabo simulaciones computacionales combinando diferentes metodologías a fin de describir a nivel molecular el mecanismo de inhibición de la P-gp humana. Este proteína es un transportador transmembrana que reconoce y bombea fuera de la célula una variedad de compuestos antitumorales por lo que su acción disminuye drásticamente la efectividad de las quimioterapias y resulta un blanco de la mayor relevancia en Química Medicinal. La necesidad de inhibidores de P-gp clínicamente viables reside en la ausencia tales fármacos y los efectos colaterales de compuestos activos ensayados in vitro, razón por la cual la alternativa de productos biosintetizados por plantas resulta particularmente atractiva tanto por su actividad como por sus efectos colaterales mucho menos importantes. La presente propuesta integra grupos de dos universidades argentinas involucrados tanto en el ensayo de nuevos inhibidores a partir de plantas autóctonas como en la comprensión a nivel básico y molecular del mecanismo de inhibición operante, a fin de obtener pistas que permitan la identificación de nuevos y más efectivos inhibidores. El pinoresinol aislado de Melia azedarach fue descripto preliminarmente como un inhibidor competitivo de la Pgp en un sitio previamente validado como relevante para la interacción de este tipo de inhibidores. Entre las técnicas computacionales a emplear se cuentan el cálculo con métodos de estructura electrónica, docking molecular y dinámica molecular.

Química Computacional Aplicada al Estudio de Celdas Solares

Docentes: Dr. Mariano Vera,  Bioq. Lanza Castronuovo

Plazas: 2

Carga horaria: 4 meses. 8 hs. semanales

Requisitos: 

• Fisicoquímica I (Licenciatura)
• Fisicoquímica (Bioquímica)
• Química Orgánica I (Bioquímica)

Tareas a realizar: La propuesta involucra el diseño racional de moléculas en un trabajo interdisciplinario incluyendo su estudio electroquímico, fotofísico y posterior construcción de modelos de prueba de principios. Se llevarán a cabo cálculos computacionales empleando la teoría del funcional de la densidad dependiente del tiempo y simulaciones de dinámica molecular a fin de predecir los espectros de absorción y emisión y el comportamiento electroquímico de estos materiales a fin de seleccionar los más prometedores para su síntesis que también se llevará a cabo en el Dpto de Química de la FCEyN y su estudio fotofísico posterior en la UNRC. El estudiante podrá optar también por el estudio del mecanismo de síntesis orgánica para obtener las moléculas tipo [Donor]-[puente alifático tensionado]- [Aceptor] buscadas en vez del modelado de la fotoquímica.
Las tareas proupuestas permitirán al practicante familiarizarse con las metodologías de Modelado, realizar simulaciones en supercomputadoras on site y remotamente en centros de supercálculo, empleando software masivamente paralelo en CPUs y GPUs.
También adquirirá experiencia en el uso de software de modelado ampliamente utilizado a nivel de producción y desempeñarse en entorno Linux. Se prevee una estrecha colaboración con grupos llevando a cabo la síntesis de compuestos y armado de dispositivos mediante visitas desde y hacia universidades involucradas en la colaboración del proyecto.

Microbiología ambiental y aplicada

Directores: Dras. Corina Berón y Fabiana Consolo

Plazas: 2

Carga horaria: 6 meses. 10 hs. semanales

Requisitos: 

• Microbiología general
• Biología Vegetal 

Entrevista

Preferentemente alumnos del último año de la carrera en Ciencias Biológicas, interesados en realizar la Tesina de Licenciatura orientada en el estudio enfermedades fúngicas en plantas.

Tareas a realizar: La producción de arroz en el área del Cono Sur de América abarca una superficie de 4.300.000 ha. Una de las principales limitantes del cultivo, es la enfermedad causada por el hongo Magnaporthe oryzae (anamorfo: Pyricularia oryzae Cavara) denominada “piriculariosis devastadores en la producción.
Entre los objetivos de este proyecto se pretende conocer las especies del fitopatógeno Pyricularia presentes en malezas y aportar conocimientos sobre la posible transmisión de la enfermedad en plantas cultivadas.
El practicante recibirá entrenamiento en técnicas de aislamiento, identificación y caracterización y conservación de cepas de Pyricularia. Por otra parte,realizará extracciones de ADN,amplificación por PCR y electroforesis en gel.Se realizarán tareas de microbiología general que incluirán preparación de materiales estériles y medios de cultivo y repique de cultivos fúngicos

Metabolismo del Carbono y del Nitrógeno en organismos fotosintéticos oxigénicos y su vinculación con cambios ambientales

Directores: Dras: Graciela Salerno, María Victoria Martin

Plazas: 2

Carga horaria: 6 meses. 10 hs. semanales

Requisitos: 

• Microbiología general

Entrevista

Tareas a realizar: El practicante recibirá entrenamiento en técnicas de bioinformática, preparación de material estéril, siembra de semillas de manera estéril y en suelo. Transformación de plantas salvajes para obtener plantas transgénicas.
Tinciones histoquímicas y técnicas de microscopía (óptica, fluorescencia, confocal)

Metabolismo del Carbono y del Nitrógeno en organismos fotosintéticos oxigénicos y su vinculación con cambios ambientales

Directores: Dras: Graciela Salerno, María Victoria Martin

Plazas: 2

Carga horaria: 6 meses. 10 hs. semanales

Requisitos: 

• Microbiología general

Entrevista

Tareas a realizar: El practicante recibirá entrenamiento en técnicas de bioinformática, preparación de material estéril, siembra de semillas de manera estéril y en suelo. Transformación de plantas salvajes para obtener plantas transgénicas.
Tinciones histoquímicas y técnicas de microscopía (óptica, fluorescencia, confocal).

Microbiología ambiental y aplicada a procesos biotecnológicos

Directores: Dras: Graciela Salerno, Corina Berón, Marina Battaglia y Dr. Mauro Do Nascimento

Plazas: 1

Carga horaria: 5 meses. 10 hs. semanales

Requisitos: 

• Microbiología general
• Biología vegetal

Entrevista

Tareas a realizar: Preparación de material vegetal para experimentos (semillas y sustrato), toma y análisis de datos (peso fresco y seco de plantas), crecimiento de líneas transgénicas, cosecha de semillas.
Se entrenará al estudiante para el uso de material de origen de vegetal en el laboratorio, desde la preparación de la semilla, germinación y crecimiento en sustrato. En el caso de las líneas transgénicas de Arabidopsis deberá crecer en condiciones de esterilidad. Además realizará diferentes tareas en el laboratorio como pueden ser el cultivo de bacterias, electroforesis en gel de muestras de DNA , etc.

Microbiología ambiental y aplicada a procesos biotecnológicos

Directores: Dras: Graciela Salerno, Corina Berón, Marina Battaglia y Fabiana Consolo

Plazas: 1

Carga horaria: 6 meses. 10 hs. semanales

Requisitos: 

• Microbiología general
• Biología vegetal

Entrevista

Tareas a realizar: El practicante evaluará el efecto de la interacción con hongos que beneficien el crecimiento de la planta, en condiciones normales de crecimiento o de estrés hídrico.
Con este fin, utilizará aislados de Trichoderma y los evaluará con diferentes plantas (poroto, maiz, tomate, etc). Para esto el practicante deberá preparar las semillas, inocularlas, germinarlas y luego pasar a suelo.
Posteriormente evaluar el crecimiento de la planta, midiendo parámetros fenotípicos (peso fresco o seco de las partes de la planta, largo de raíz).

Metabolismo del Carbono y del Nitrógeno en organismos fotosintéticos oxigénicos y su vinculación con cambios ambientales

Directores: Dras: Graciela Salerno, Macarena Pérez Cenci

Plazas: 1

Carga horaria: 6 meses. 8 hs. semanales

Requisitos: 

• Química Biológica I
• Microbiología general o Química Analítica
• Biología vegetal

Entrevista

Tareas a realizar: Recibir capacitación en el manejo de cultivos estériles, el cultivo de cepas de cianobacterias para el estudio de la acumulación de hidratos de carbono solubles, la cuantificación de azúcares solubles y estructurales, la obtención y separación de polisacáridos por métodos cromatográficos, la medición de actividades enzimáticas, la determinación de parámetros bioquímicos, la extracción de ácidos nucleicos y el uso de herramientas de bioinformática.

Metabolismo del Carbono y del Nitrógeno en organismos fotosintéticos oxigénicos y su vinculación con cambios ambientales

Directores: Dras: Graciela Salerno, Laura Giarrocco

Plazas: 1

Carga horaria: 6 meses. 8 hs. semanales

Requisitos: 

• Química Biológica I y II
• Microbiología general o Química Analítica (No excluyente)
• Biología vegetal

Entrevista

Tareas a realizar: Recibir capacitación en metodologías microbiológicas, cultivo de cepas de cianobacterias, bioensayos para búsqueda de actividades mosquitocidas, identificación de compuestos activos presentes en los extractos de cianobacterias, introducción a las técnicas de ingeniería genética, amplificaciones por PCR y herramientas de bioinformática.

Metabolismo del Carbono y del Nitrógeno en organismos fotosintéticos oxigénicos y su vinculación con cambios ambientales

Directores: Dras: Graciela Salerno, Giselle Martínez-Noël

Plazas: 1

Carga horaria: 6 meses. 10 hs. semanales

Requisitos: 

• Microbiología general

Entrevista

Tareas a realizar: El practicante aprenderá el manejo de la planta modelo Arabidopsis thaliana y la caracterización de mutantes.
Dentro de las actividades se incluirá la preparación de material estéril, siembra y crecimiento de Arabidopsis en condiciones de esterilidad, evaluación de fenotipo en condiciones normales y bajo estreses abióticos y una introducción en técnicas de biología molecular como por ejemplo la realización de RT-PCRs.

Metabolismo del Carbono y del Nitrógeno en organismos fotosintéticos oxigénicos y su vinculación con cambios ambientales

Directores: Dras: Graciela Salerno, Giselle Martínez-Noël

Plazas: 1

Carga horaria: 6 meses. 10 hs. semanales

Requisitos: 

• Microbiología general

Entrevista

Tareas a realizar: El practicante aprenderá el manejo del alga modelo Chlamydomonas reinhardtii. Dentro de las actividades se incluirá la preparación de material estéril, cultivo del alga en condiciones normales y bajo diferentes estreses abióticos, curvas de crecimiento y una introducción en técnicas de bioquímica (medición de almidón y lípidos) y biología molecular (RT-PCRs).

Microbiología ambiental y aplicada

Directores: Dras: Graciela Salerno, Corina Berón, Lic. Rocío Lopez y Nicolás Lazarte

Plazas: 1

Carga horaria: 5 meses. 10 hs. semanales

Requisitos: 

• Microbiología general

Entrevista

Tareas a realizar: El practicante recibirá entrenamiento y colaborará en actividades de aislamiento de microorganismos patógenos y/o simbiontes de mosquitos por medio de técnicas de microbiología clásica y molecular, así como el desarrollo de bioensayos. De acuerdo con el desempeño del pasante se evaluará la posibilidad de realizar presentaciones a congresos y/o la continuidad de las actividades por medio de la tesina de grado.